Im Jahr nach seiner Wahl erhält Christoph Bernhard von Galen kurz nacheinander die Priester- und die Bischofsweihe. Sein unterlegener Gegenkandidat Mallinckrodt opponiert noch jahrelang gegen den Fürstbischof, bis dieser ihn 1657 lebenslang einsperren lässt. Anders als seine Vorgänger, die sich teilweise nur wenig mit dem Fürstbistum beschäftigten, kümmert sich von Galen ausschließlich um die Belange des Hochstifts.  
 
In den ersten zehn Jahren als Fürstbischof widmet sich Christoph Bernhard hauptsächlich innenpolitischen und kirchlichen Themen. Es gilt die Wunden des Dreißigjährigen Kriegs zu heilen. Die Gerichtsbarkeit muss wiederhergestellt, das religiöse Leben belebt und zerstörte Kirchen neu aufgebaut werden. Von Galen beseitigt das in der Priesterschaft weitverbreitete Zusammenleben mit einer Frau und sorgte mit verschiedenen Maßnahmen und Zusammenkünften für eine reformeifrige Geistlichkeit.  
 
Außerdem sind nach dem Krieg in einigen Städten immer noch fremde Truppen stationiert. Die Hessen halten Coesfeld, die niederländischen Oranier Bevergern und die Schweden Vechta besetzt. Mit viel Geld und politischem Geschick bringt der Bischof diese Städte wieder unter seine Kontrolle.